Obrazowanie powierzchni i struktury wewnętrznej pozwala na wizualizację zarówno zewnętrznych, jak i wewnętrznych cech obiektów. Znajdują one szerokie zastosowanie w różnych dziedzinach nauki i przemysłu, takich jak: medycyna, inżynieria materiałowa, przemysł lotniczy czy nauki biologiczne. COMEF posiada w swojej ofercie takie urządzenia jak: skaningowe mikroskopy elektronowe, napylarki, systemy Cryo-SEM, mikrotomografy komputerowe czy mikroskopy sił atomowych.